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本田直树 生命科学研究科特命教授（兼?広島大学教授、生命創成探究センター客員教授）、近藤武史 同特定助教、大河内康之 医学部生、坂口峻太 生命科学研究科?日本学術振興会特別研究員、中江健 情报学研究科特定助教らの研究グループは、1細胞RNAシーケンシング（RNA-seq）法で計測された遺伝子発現データから、遺伝子発現の空間的パターンをあたかもパズルを解くかのように再構成する機械学習法（Perler）を開発しました。
この提案手法は、従来法と比べて高精度かつ顽健に空间的遗伝子発现パターンを再构成することが示されました。正确な空间遗伝子発现パターンの再构成が実现されたことにより、発生过程における形作りや多细胞からなる组织机能の理解にも贡献することが期待されます。さらに、再生医疗として作成されたミニ臓器が、実际の体内臓器をどの程度再现しているのかなどの评価に応用されることが期待されます。&苍产蝉辫;
本研究成果は、2021年6月17日に、国際学術誌「Nature Communications」に掲載されました。
研究者情报
研究者名
本田直树
研究者名
近藤武史
研究者名
中江健
书誌情报
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Yasushi Okochi, Shunta Sakaguchi, Ken Nakae, Takefumi Kondo, Honda Naoki (2021). Model-based prediction of spatial gene expression via generative linear mapping. Nature Communications, 12, 3731.
